γδ-Т-лимфоциты составляют основной компонент пула лимфоцитов кишечного эпителия. Последние данные указывают на то, что эти клетки очень подвижны и активно «сканируют» эпителий на наличие признаков клеточного стресса. Как уже отмечалось ранее, γδ-Т-клетки распознают на клетках эпителиальных пластов наличие стресс-молекул MICA и MICB, которые функционируют как триггеры цитотоксичности. Так, MICA и MICB активируют цитотоксические NK-подобные IELs и NK-клетки через NKG2D и CD94/NKG2C рецепторы. Контакт эпителиальных клеток с кишечными бактериями может индуцировать экспрессию γδ-Т-клетками антимикробных пептидов. γδ-Т-клетки могут проявлять широкую цитотоксическую активность в отношении инфицированных клеток, которая обусловлена взаимодействием FasL с FasR на клетках-мишенях и продукцией перфорина/гранзима для дестабилизации клеточной мембраны с индукцией апоптоза. γδ-Т-клетки также секретируют различные цитокины и хемокины, включая провоспалительные Th1 цитокины, такие как IFN-γ и TNF-α, необходимые для активации DCs и Th1. Благодаря этим цитотоксическим свойствам γδ-Т-клетки, наряду с CD8+ Т- и NK-клетками, являются мощным инструментом элиминации зараженных вирусами и внутриклеточными бактериями клеток.

Активация NK- и NKT-клеток также происходит при распознавании микробов с помощью PRR и/или Т-клеточного рецептора. NK-клетки и NKT-клетки, расположенные среди энтероцитов, также играют важнейшую роль в защите первой линии, используя разнообразные эффекторные механизмы. Например, IL-15 играет ключевую роль в усилении цитолитической активности IELs за счет увеличения экспрессии на эпителии кишечника MICA и MICB. Продукция IL-15 приводит к цитотоксическому поражению эпителиальных клеток и повышению проницаемости кишечника для различных люминальных макромолекул, включая иммуногенные пептиды глютена.

Если устойчивое состояние организма-хозяина нарушается из-за травмы или атаки агрессивных патогенов или под воздействием токсинов, связывание PRRs на энтероцитах, с PAMPs/DAMPs активирует эти клетки для выработки «аларминов» (IL-1β при инфекции Candida sp.., IL-33, IL-25, TSLP – при глистной инвазии или IL-12 – при вирусной инфекции), а также привлекает из циркуляции к месту инфекции DCs и другие, соответствующие каждому типу воспаления (см. в других разделах) клетки врожденного иммунитета (моноциты, нейтрофилы, эозинофилы и т.д.). Нейтрофилы, наряду с дегрануляцией и фагоцитозом, продуцируют IL-18, который в сочетании с IL-12, продуцируемым DCs, стимулирует NK-клетки к высвобождению IFNg. IFNg активирует DCs и макрофаги и усиливает выработку воспалительных цитокинов. Оксид азота, вырабатываемый активированными фагоцитами, особенно эффективен в ингибировании репликации вируса и может изменять рН микроокружения. Нейтрофилы также захватывают внеклеточные бактерии в нейтрофильные внеклеточные ловушки, которые состоят из хроматинового каркаса, связанного с антимикробными белками азурофильных и специфических гранул. Исследования реакций врожденного иммунитета в BALT показали, что большое количество нейтрофилов, рекрутированных в места бактериальной инфекции в легких, может быть столь же разрушительным, как и действие патогенов, которых они пытаются уничтожить. Хотя эти лейкоциты жизненно важны для защиты от таких видов бактерий, как Klebsiella pneumoniae и Streptococcus pneumoniae, накопление слишком большого количества нейтрофилов может привести к острому повреждению ткани легких или острому респираторному дистресс-синдрому. Избыток IL-18, высвобождаемый активированными нейтрофилами, может стимулировать другие лейкоциты для продукции про-воспалительных цитокинов. Повреждению нежной слизистой оболочки легких способствует разрушение внеклеточных бактерий в нейтрофильных ловушках, которое вызывает высвобождение большого количества микробных веществ.