Локальный иммунный ответ основан на распознавании чужеродных агентов с помощью специальных патоген-распознающих рецепторов (PRR) экспрессирующих, в основном, на клетках врожденного иммунитета (эпителиальные клетки, макрофаги, моноциты, дендритные клетки, нейтрофилы и пр.). Они напрямую распознают специфические молекулярные структуры на поверхности патогенов, апоптотических клеток, поврежденных и стареющих клеток. Благодаря распознаванию и связыванию лигандов PRR осуществляют иммунозащитные эффекты.
PRR состоят из доменов распознавания лиганда, промежуточных доменов, и эффекторных доменов. Распознавая и связывая соответствующие лиганды через свои эффекторные домены PRR привлекают адапторные молекулы и инициируя нижестоящие сигнальные пути для оказания множество эффектов: рекрутирование и высвобождение цитокинов, хемокинов, гормонов и факторов роста; индуцирование хронического воспаления; формирование воспалительного микроокружения; инициирование врожденного им-мунного уничтожения и последующего приобретенного иммунного ответа, поддерживая баланс микроэкологии хозяина; и удаление мертвых или мутировавших клеток.
Распознавание и связывание PRR с лигандами имеет решающее значение в инициации и правильном функционировании не только в врожденного иммунитета, но и опосредовано осуществляет своевременную инициацию антиген-специфического адаптивного иммунного ответа.
По гомологии белковых доменов PRR можно разделить на пять типов:
Толл-подобные рецепторы (TLR),
Рецепторы, подобные домену олигомеризации нуклеотидов (NLR),
Индуцируемые ретиноевой кислотой ген-I-подобные рецепторы (RLR),
Лектиновые рецепторы C-типа (CLR)
Отсутствующие в меланоме-2 (AIM2)-подобные рецепторы (ALR).
Особым сенсором является стимулятор генов интерферона (STING).
Отдельную группу составляют внеклеточные растворимые молекулы распознавания образов (PRM) которые обладая в основном эффекторными реже регуляторными механизмами действия.

По функции все PRR могут быть разделены на сигнальные и эндоцитозные. Первая группа рецепторов позволяет выявлять патоген-ассоциированные молекулярные структуры (PAMP), и/или молекулярные структуры, связанные с повреждением – DAMP. Вторая группа рецепторов — эндоцитозные PRR обеспечивает процессы фагоцитоза и последующую до-ставку патогена в лизосомы (начало адаптивного иммунного ответа) и активирует эффероцитоз (узнавание и поглощение апоптотических клеток).